Protein–RNA interactions for Protein: Q99102

MUC4, Mucin-4, humanhuman

Predictions only

Length 2,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC4Q99102 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC4Q99102 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MUC4Q99102 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms