Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms