Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCEEQ96PE7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCEEQ96PE7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms