Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS1

YPEL4, Protein yippee-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL4Q96NS1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YPEL4Q96NS1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
YPEL4Q96NS1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms