Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF560Q96MR9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF560Q96MR9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms