Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC114Q96M63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms