Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA7LQ96GN5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7LQ96GN5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDCA7LQ96GN5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms