Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CPNE2Q96FN4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE2Q96FN4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms