Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
MFSD3Q96ES6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MFSD3Q96ES6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms