Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTSSAQ969W0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms