Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS3Q969F9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms