Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRF1Q92994 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms