Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms