Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPRYD3Q8NCJ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms