Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF182Q8N6D2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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RNF182Q8N6D2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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RNF182Q8N6D2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF182Q8N6D2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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