Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRACR2BQ8N4Y2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRACR2BQ8N4Y2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms