Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZBED8Q8IZ13 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED8Q8IZ13 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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