Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNMB4Q86W47 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNMB4Q86W47 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms