Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC84Q86UT8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms