Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN4Q6ZMN7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN4Q6ZMN7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms