Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP1BQ659C4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP1BQ659C4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms