Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RRAGBQ5VZM2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRAGBQ5VZM2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms