Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOM1Q5C9Z4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms