Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms