Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms