Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL12Q53G59 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL12Q53G59 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms