Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC38Q502W7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC38Q502W7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms