Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
KRTAP20-2Q3LI61 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms