Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCK2Q16822 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms