Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPE65Q16518 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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