Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEC23BQ15437 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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SEC23BQ15437 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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