Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NECTIN1Q15223 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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