Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1DQ13901 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C1DQ13901 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1DQ13901 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C1DQ13901 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C1DQ13901 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C1DQ13901 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1DQ13901 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1DQ13901 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1DQ13901 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C1DQ13901 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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