Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHROOM2Q13796 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHROOM2Q13796 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
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