Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF5Q13568 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF5Q13568 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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