Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBX3Q13185 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms