Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSPB3Q12988 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HSPB3Q12988 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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