Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 CLK3-218ENST00000566926 646 ntTSL 512.62□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 IFT172-212ENST00000479419 420 ntTSL 312.6□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 IFT172-216ENST00000507184 5565 ntTSL 512.56□□□□□ -0.45e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-207ENST00000395914 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.45e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 MAST4-203ENST00000403666 7586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TTLL5-202ENST00000298832 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TARBP2-217ENST00000551741 992 ntTSL 212.16□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 CALML4-204ENST00000448060 2520 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TTLL5-213ENST00000555422 2155 ntTSL 512.08□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 RAP1GAP-207ENST00000447293 429 ntTSL 211.98□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 CLK3-216ENST00000564468 929 ntTSL 311.92□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 BID-210ENST00000552886 330 ntTSL 311.9□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 EIF4G1-231ENST00000464548 637 ntTSL 511.87□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-212ENST00000451915 584 ntTSL 311.71□□□□□ -0.535e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 HOMER3-212ENST00000600077 675 ntTSL 311.7□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 311.68□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 MAST4-204ENST00000405643 7713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 PRODH2-203ENST00000587808 515 ntTSL 211.51□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TARBP2-216ENST00000551157 1008 ntTSL 311.45□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 MAST4-201ENST00000261569 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 HAUS7-208ENST00000490165 817 ntTSL 311.36□□□□□ -0.595e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 IFT172-201ENST00000260570 5415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.595e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AL603832.3-202ENST00000607158 807 ntTSL 511.02□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AL603832.3-204ENST00000605933 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.02□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 EIF2A-203ENST00000460851 2198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 NUP214-210ENST00000496921 2977 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ASXL2-202ENST00000404843 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TARBP2-219ENST00000552817 668 ntTSL 310.97□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 CTDP1-206ENST00000590635 489 ntTSL 510.77□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 INTS3-210ENST00000512605 3442 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 CALML4-201ENST00000354678 611 ntTSL 310.69□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 SP1-201ENST00000327443 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 NUP214-211ENST00000498010 483 ntTSL 510.61□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 SP1-204ENST00000551969 602 ntTSL 310.58□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ZMIZ2-213ENST00000492001 680 ntTSL 310.57□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TTLL5-221ENST00000557636 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 510.23□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 DECR2-208ENST00000461802 878 ntTSL 510.16□□□□□ -0.785e-16■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TARBP2-206ENST00000547064 759 ntTSL 310.11□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ARHGEF7-218ENST00000491775 581 ntTSL 410.09□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 WARS-229ENST00000556435 528 ntTSL 210.07□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 HOMER3-211ENST00000599808 555 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TARBP2-208ENST00000547541 430 ntTSL 39.9□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AL603832.3-201ENST00000471038 792 ntTSL 29.89□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 UBR4-211ENST00000467272 891 ntTSL 59.75□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 VAMP8-201ENST00000263864 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 GPBP1L1-214ENST00000498128 559 ntTSL 39.58□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 EIF4G1-211ENST00000422614 750 ntTSL 59.47□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 INTS3-209ENST00000503133 1896 ntTSL 29.42□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 DKC1-207ENST00000473552 656 ntTSL 29.41□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 NTAN1-203ENST00000565187 1043 ntTSL 29.29□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.955e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 RHOC-211ENST00000436685 517 ntTSL 59.07□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TUBG1-203ENST00000589613 916 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -15e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 VAMP8-202ENST00000409760 805 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -15e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 PLEKHH1-216ENST00000561456 595 ntTSL 48.82□□□□□ -15e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ABCA5-203ENST00000586811 1948 ntTSL 58.39□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-209ENST00000420474 879 ntTSL 28.3□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 DKC1-206ENST00000452771 708 ntTSL 58.1□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TTLL5-218ENST00000556976 513 ntTSL 48.08□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 SP1-203ENST00000548560 1061 ntTSL 27.91□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 CNIH3-207ENST00000481095 747 ntTSL 37.9□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ADAR-205ENST00000492630 612 ntTSL 27.84□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 DST-203ENST00000340834 5024 ntTSL 27.81□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 PRODH2-205ENST00000589835 612 ntTSL 57.54□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 DKC1-205ENST00000437719 686 ntTSL 37.54□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 NTAN1-205ENST00000566542 2398 ntTSL 27.49□□□□□ -1.215e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ADAR-208ENST00000529168 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.41□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 USP7-217ENST00000567329 567 ntTSL 47.28□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 INTS3-205ENST00000476843 3404 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.265e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 DKC1-203ENST00000413910 851 ntTSL 57.17□□□□□ -1.265e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 EIF2A-216ENST00000494558 710 ntTSL 57.12□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 CNIH3-214ENST00000498382 897 ntTSL 27.09□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 RAP1GAP-208ENST00000464457 409 ntTSL 37.07□□□□□ -1.285e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 NTAN1-204ENST00000566419 738 ntTSL 36.98□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 NTAN1-202ENST00000563940 354 ntTSL 56.88□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 IFT172-204ENST00000420854 569 ntTSL 56.71□□□□□ -1.345e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 EIF2A-204ENST00000462221 817 ntTSL 56.7□□□□□ -1.345e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 NTAN1-209ENST00000568738 439 ntTSL 26.67□□□□□ -1.345e-6■■■■■ 35.2
SF3A3Q12874 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.355e-6■■■■■ 35.2
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