Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 OAR1YKL055C 837 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 RPL40BYKR094C 387 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 BER1YLR412W 825 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 CMC2YBL059C-A 330 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 QCR2YPR191W 1107 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 APD1YBR151W 951 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 GEM1YAL048C 1989 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 PUF2YPR042C 3228 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 RTC5YOR118W 1704 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 YMR046CYMR046C 1323 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 AXL2YIL140W 2472 nt3.92□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 TAF7YMR227C 1773 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 DHR2YKL078W 2208 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 SUL2YLR092W 2682 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 DIP2YLR129W 2832 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 SED4YCR067C 3198 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 YCR007CYCR007C 720 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 Q0032Q0032 291 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 GET1YGL020C 708 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 TPK3YKL166C 1197 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 RNA14YMR061W 2034 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 SVS1YPL163C 783 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 MRPS9YBR146W 837 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 SRP1YNL189W 1629 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 NTH1YDR001C 2256 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 YOL075CYOL075C 3885 nt3.91□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 PHM7YOL084W 2976 nt3.9□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 MCD4YKL165C 2760 nt3.9□□□□□ -1.78
MSL5Q12186 YJL206CYJL206C 2277 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 NCB2YDR397C 441 nt3.9□□□□□ -1.79 RIP-Chip
MSL5Q12186 SPI1YER150W 447 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SEC4YFL005W 648 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 ECL1YGR146C 636 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 RPS20YHL015W 366 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YJL119CYJL119C 324 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 PBI2YNL015W 228 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 PIG2YIL045W 1617 nt3.9□□□□□ -1.79 RIP-Chip
MSL5Q12186 YPL109CYPL109C 1974 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SOF1YLL011W 1470 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SPB4YFL002C 1821 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 MRH4YGL064C 1686 nt3.9□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 RVB1YDR190C 1392 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YVC1YOR087W 2028 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 RSM24YDR175C 960 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 PRE9YGR135W 777 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 PET54YGR222W 882 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 FMP46YKR049C 402 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 FLD1YLR404W 858 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 RPS19AYOL121C 435 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 INA17YPL099C 549 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YPR059CYPR059C 387 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 snR24snR24 89 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SWP82YFL049W 1872 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 CUE3YGL110C 1875 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SEG1YMR086W 2883 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 ESA1YOR244W 1338 nt3.89□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 RPA14YDR156W 414 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 RPL28YGL103W 450 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SDO1YLR022C 753 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YLR224WYLR224W 1110 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 GLO1YML004C 981 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 ATP18YML081C-A 180 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 TIF11YMR260C 462 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 POF1YCL047C 777 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SEN1YLR430W 6696 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 MGS1YNL218W 1764 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 AIM21YIR003W 2040 nt3.88□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 AGA1YNR044W 2178 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SPT23YKL020C 3249 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 GCR1YPL075W 2358 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YCR013CYCR013C 648 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YDL228CYDL228C 642 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 SWF1YDR126W 1011 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 ECM34YHL043W 513 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YET1YKL065C 621 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 MCR1YKL150W 909 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 ARC18YLR370C 537 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 RAD33YML011C 534 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 RPS11BYBR048W 471 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 MRPL51YPR100W 423 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 PDR12YPL058C 4536 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 MTL1YGR023W 1656 nt3.87□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 GLC3YEL011W 2115 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 NEL1YHR035W 1893 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YCR050CYCR050C 309 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 FAD1YDL045C 921 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 AUA1YFL010W-A 285 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YGR228WYGR228W 345 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YKL083WYKL083W 615 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YKL136WYKL136W 399 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 ATG10YLL042C 504 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YLR297WYLR297W 390 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 TDA5YLR426W 981 nt3.86□□□□□ -1.79
MSL5Q12186 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms