Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNK2Q07912 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNK2Q07912 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms