Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FMODQ06828 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FMODQ06828 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FMODQ06828 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FMODQ06828 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FMODQ06828 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms