Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 DBP10YDL031W 2988 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 PBI1YPL272C 1554 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 HPA3YEL066W 540 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 CFD1YIL003W 882 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YIL089WYIL089W 618 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 EMC2YJR088C 879 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YLL037WYLL037W 381 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 TEM1YML064C 738 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YET2YMR040W 483 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 RPL20AYMR242C 519 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YNL109WYNL109W 546 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 PEX17YNL214W 600 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YOR263CYOR263C 408 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 SPS4YOR313C 1017 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 PHO88YBR106W 567 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 ARA1YBR149W 1035 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 PST1YDR055W 1335 nt2.12□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YKU80YMR106C 1890 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 TRM1YDR120C 1713 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 SPF1YEL031W 3648 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YER147C-AYER147C-A 411 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YGR160WYGR160W 612 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 EFG1YGR271C-A 702 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 SAM37YMR060C 984 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 MRPL33YMR286W 261 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YOL050CYOL050C 321 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 PFK27YOL136C 1194 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 CAF20YOR276W 486 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 SMY2YBR172C 2223 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 CWC22YGR278W 1734 nt2.11□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 ITT1YML068W 1395 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 MTL1YGR023W 1656 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 NET1YJL076W 3570 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YDR090CYDR090C 933 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 RPL23BYER117W 414 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YGR107WYGR107W 450 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 NDL1YLR254C 570 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YMR310CYMR310C 954 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 RPL23AYBL087C 414 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 GIN4YDR507C 3429 nt2.1□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 ISW1YBR245C 3390 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 SIR3YLR442C 2937 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 MSB2YGR014W 3921 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 AIM11YER093C-A 414 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 ERP6YGL002W 651 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 PEX14YGL153W 1026 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YNL184CYNL184C 327 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 MDJ2YNL328C 441 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 SUR1YPL057C 1149 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YPR078CYPR078C 1119 nt2.09□□□□□ -2.07
UPS3Q04006 YJL181WYJL181W 1836 nt2.09□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 TRM12YML005W 1389 nt2.09□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 GEA1YJR031C 4227 nt2.09□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 SNX41YDR425W 1878 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 MNT3YIL014W 1893 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 SNX4YJL036W 1272 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 REX3YLR107W 1215 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 MRPS17YMR188C 714 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 MIC27YNL100W 705 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 ATG3YNR007C 933 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YBL094CYBL094C 333 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 MRP2YPR166C 348 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 DAD3YBR233W-A 285 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 ABD1YBR236C 1311 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 HUL5YGL141W 2733 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 MED1YPR070W 1701 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 NAB3YPL190C 2409 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YOR365CYOR365C 2112 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 SAS4YDR181C 1446 nt2.08□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 TPO5YKL174C 1857 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 TPS2YDR074W 2691 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 MSS4YDR208W 2340 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YCG1YDR325W 3108 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 PMI40YER003C 1290 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 DOG1YHR044C 741 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 RSM26YJR101W 801 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 MST28YAR033W 705 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 SAS2YMR127C 1017 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 VIP1YLR410W 3441 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 SRP68YPL243W 1800 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 ORC2YBR060C 1863 nt2.07□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 SOK1YDR006C 2706 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 CSF1YLR087C 8877 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 RIX1YHR197W 2292 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 ARF1YDL192W 546 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 INP1YMR204C 1263 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 SYC1YOR179C 567 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 ARO7YPR060C 771 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 PAF1YBR279W 1338 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 TAF2YCR042C 4224 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 PSK1YAL017W 4071 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YHR078WYHR078W 1659 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 DSE4YNR067C 3354 nt2.06□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 TOP2YNL088W 4287 nt2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.1 ms