Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ERCC6Q03468 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ERCC6Q03468 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ERCC6Q03468 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms