Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL23P62829 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL23P62829 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL23P62829 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL23P62829 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL23P62829 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms