Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCS1P62166 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCS1P62166 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCS1P62166 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCS1P62166 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NCS1P62166 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NCS1P62166 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NCS1P62166 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCS1P62166 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCS1P62166 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCS1P62166 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCS1P62166 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NCS1P62166 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NCS1P62166 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCS1P62166 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCS1P62166 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCS1P62166 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCS1P62166 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCS1P62166 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCS1P62166 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NCS1P62166 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCS1P62166 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NCS1P62166 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCS1P62166 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NCS1P62166 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms