Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK11-1P61568 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms