Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR2FP61218 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR2FP61218 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms