Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms