Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPHP49418 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPHP49418 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPHP49418 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPHP49418 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPHP49418 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPHP49418 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AMPHP49418 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AMPHP49418 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPHP49418 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPHP49418 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPHP49418 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AMPHP49418 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AMPHP49418 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AMPHP49418 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AMPHP49418 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AMPHP49418 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AMPHP49418 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AMPHP49418 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms