Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT5P48643 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT5P48643 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT5P48643 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT5P48643 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT5P48643 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCT5P48643 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCT5P48643 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT5P48643 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT5P48643 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT5P48643 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT5P48643 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT5P48643 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT5P48643 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT5P48643 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCT5P48643 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT5P48643 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT5P48643 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT5P48643 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT5P48643 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT5P48643 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCT5P48643 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCT5P48643 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCT5P48643 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms